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Ao contrário dos muitos tipos de câncer com sistema numérico de estadiamento (ou seja, de níveis de progressão), o CBC segue uma categorização própria baseada na chance de retorno do câncer, ou seja, seu risco de recorrência. Nesse sistema de estadiamento diferenciado, a maioria dos casos de CBC recai num destes dois grupos: o de baixo risco e o de alto risco. 

As opções de tratamento seguem essa categorização, visando evitar a recorrência. Uma terceira classe, a do CBC avançado, descreve os tumores cuja erradicação demanda procedimentos de tratamento mais complexos, em vez da remoção cirúrgica comum. O CBC avançado se espalha além da área imediata e pode exigir mais providências, como exames de imagem, para determinar a extensão afetada pelo câncer. 

Algumas características do CBC de baixo risco:

Lesão com tamanho menor do que 2 cm;

Bordas bem definidas;

Lesões localizadas no tronco ou extremidades;

Pacientes não são imunossuprimidos;

Pacientes não receberam radioterapia prévia na área atingida.

Algumas características CBC de alto risco:

Lesão com tamanho maior do que 2 cm;

Bordas mal definidas;

Lesões de qualquer tamanho localizadas na cabeça, pescoço ou pés; região pré-tibial (canela) ou anogenital (ânus e genital);

Pacientes imunossuprimidos;

Pacientes receberam radioterapia médica na área atingida.

Algumas características do CBC avançado:

Menos comum (representa menos de 10% dos casos);

Envolve adoecimento extenso, ocasionalmente com envolvimento ósseo, invasão perineural, ou envolvimento profundo de tecidos moles;

Controle requer mais métodos de tratamento;

Esses tumores têm crescimento invasivo, são relativamente maiores e, às vezes, estão localizados em áreas difíceis de tratar.